
段谟杰
武汉科技大学,化学与化工学院,教授
研究领域:生物计算模拟、膜蛋白结构与功能、蛋白质人工智能设计
招生方向:生物、化学、物理及计算机等相关专业
电话:+86 18062598505 电子邮箱:mduan@wust.edu.cn
地址:湖北省武汉市青山区和平大道947号
教育经历
2004-09 至 2009-06,华中科技大学,生物信息学,博士,导师:周艳红教授
2000-09 至 2004-06,华中科技大学,应用物理系,学士
工作经历
2024-03 至今, 武汉科技大学化学与化工学院,教授
2014-08 至2024-03, 中国科学院精密测量科学与技术研究院,副研究员
2009-12 至2014-07, 美国克拉克大学化学系,博士后
研究概况
主要聚焦于蛋白质结构与功能研究,应用和发展分子动力学模拟方法,结合增强采样、深度学习等技术探索蛋白质结构动态行为及其在功能行使中的作用。以通讯作者在Sci. Adv., JACS, Adv. Sci., JACS Au, Chem. Sci. 等权威期刊发表SCI论文50余篇,主持国家自然科学基金(两项)等项目,担任生物信息学学会生物分子结构预测与模拟专业委员会委员等。
具体研究方向如下:
(1) 膜蛋白结构动态及功能;
(2) 基于人工智能的分子动力学模拟方法及蛋白质设计;
(3) 固有无序蛋白结构与聚集;
(4) 药物-靶标结合过程及作用机制。
代表性论文
[1] H. Tan, M. Duan*, H. Xie, Y. Zhao, H. Liu, M. Yang, M. Liu, Jun Yang*. Fast collective motions of backbone in transmembrane a helices are critical to water transfer of aquaporin. Sci. Adv., 2024, 10, ade9520.
[2] H. Tan, W. Zhao, M. Duan*, Y. Zhao, Y. Zhang*, H. Xie, Q. Tong, J. Yang*. Native Cellular Membrane Facillitate Channel Activity of MscL by Enhancing Slow Collective Motions of Its Transmembrane Helices. JACS, 2024, 146:31472-31485.
[3] H. Chen, Y. Zhou, X. Wang, X. Chai, Z, Wang, E. Wang, L. Xu, T. Hou*, D. Li*, M. Duan*. Discovery of Novel Anti-Resistance AR Antagonists Guided by Funnel Metadynamics Simulation. Adv. Sci., 2024, 202309261.
[4] H. Yang, D. Zhou, Z. Zhou, M. Duan*, H. Yu*. Mechanistic Insight into the Mechanical Unfolding of the Integral Membrane Diacylglycerol Kinase. JACS Au, 2024, 4:1422-1435.
[5] Y. Liu, L. Mathew, C. Yu, L. Fu, Z. Shu*, S. Kapoor*, M. Duan*. The Molecular Mechanism of Fluorescence Lifetime of Fluorescent Probes in Cell Membrane. J. Phys. Chem. Letter, 2024, 15:12293-12300.
[6] N. Liu, Y. Guo, S. Ning, M. Duan*. Phosphorylation regulates the binding of intrinsically disordered proteins via a flexible conformation selection mechanism. Comms. Chem., 2020, 3:123.
[7] M. Duan, N. Liu, W. Zhou, D. Li, M. Yang*, T. Hou*. Structural diversity of ligand-binding androgen receptors revealed by microsecond long molecular dynamics simulations and enhanced sampling. J. Chem. Theory Comput. 2016, 12:4611-4619.